最終のセブンス･シーズンでは、ヒーローたちが崩壊した聖域サンクタムを立て直すところから始まる。母親の死をまだ引きずっているクラーク（イライザ･テイラー）は、長きに渡る戦争と喪失への犠牲を誰よりも感じている。人々が派閥の中で秩序を維持することは簡単ではなく、より良い世界にするという彼らの約束が代償に見合うものであったかどうか疑問を感じている。

同時に、ヒーローたちは、“アノマリー”の謎を解き明かしながら、これまでに経験したことのない規模の新たな障害に立ち向かわなければならない。この壮大な旅で、彼らは肉体的にも精神的にも限界に達し、家族、愛、犠牲に対する長年の考えに疑問を抱くようになる。最終的にヒーローたちは、ただ生き残るだけでなく、本当の意味で生きることが何を意味するのか、自分たちで答えを出さなければならない。