ファースト･シーズンの終盤で、クロエはルシファーが死んでいく姿を目撃したが、彼が再び息を吹き返し、ルシファーの素性についてさらに混乱してしまう。一方、疎遠になった夫であり、同じロサンゼルス市警の刑事であるダン（ケヴィン･アレハンドロ）は、腐敗した事件への関与を告白し、仕事だけではなくクロエとの関係までもが危うくなる。セカンド･シーズンでは、地獄へ戻るのを拒否するルシファーに異論を唱えていた兄の天使アメナディエル（Ｄ･Ｂ･ウッドサイド）が登場する。ルシファーとアメナディエルはある目的のために協力しなければならない――２人の母であるシャーロット（トリシア・エルファー）が地獄から逃げ出してしまったからだ。ルシファーは父親に似ていない。彼が似ている母親は、さぞかし恐ろしい人物だろう。

警察には、エラ･ロべス（エイミー・ガルシア）という頭脳明晰でたくましい科学捜査官が新たに加わり、ルシファーとロサンゼルス市警との仕事も状況が一変する。ルシファーは、宗教と科学を同等に信じるエラに興味を示す。母親が逃走する中、ルシファーにとって、セラピストであるだけでなく親友的存在になっているドクター リンダ･マーティン（レイチェル･ハリス）は、彼に多くの助言をしてくれるだろう。そして、助言をし終えた彼女は、自分自身のセラピストが必要になるかもしれない。